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'Aprendizaje automático e integración de biomarcadores multiómicos para prevenir la recurrencia inesperada y evitar la quimioterapia innecesaria en mujeres con cáncer de endometrio'. Ese es el título del proyecto conseguido por el Laboratorio de Epigenética del Cáncer y Nanomedicina del CINN-CSIC, que dirige Mario Fernández Fraga, uno de los ocho a nivel nacional de la Asociación Española Contra el Cáncer, y que busca mejorar el diagnóstico y guiar tratamientos más personalizados y efectivos para este tipo de cáncer ginecológico. Su duración será de tres años y contará con una financiación de 300.000 euros.
El Laboratorio de Epigenética del Cáncer y Nanomedicina del CINN-CSIC, también pertenece al Instituto de Investigación Sanitaria del Principado de Asturias (ISPA), al Instituto Universitario de Oncología del Principado de Asturias (IUOPA, Universidad de Oviedo) y al Centro de Investigación en red de enfermedades raras (CIBERER, Instituto de Salud Carlos III). Para este proyecto, además, será fundamental la participación del Servicio de Anatomía Patológica como responsable del Banco de Tumores y del Servicio de Ginecología, ambos del HUCA, que serán los encargados de recoger las muestras de las pacientes.
Según explica la doctora Annalisa Roberti, investigadora senior del laboratorio, la importancia del proyecto radica en abordar desafíos clínicos cruciales en el tratamiento del cáncer de endometrio. «Este proyecto surge de una estrecha colaboración entre nuestro laboratorio y el departamento de oncología ginecológica del Hospital Universitario Central de Asturias (HUCA) encabezado por la Dr. Isabel Palacio. Con este proyecto nos proponemos identificar biomarcadores pronóstico que permitan clasificar a las pacientes que realmente necesitan quimioterapia adyuvante postoperatoria, previniendo o retrasando la recurrencia». Los resultados tendrán, asimismo, una relevancia social, de salud y económica al evitar tratamientos innecesarios.
El Grupo de Epigenética del Cáncer y Nanomedicina se ha consolidado como líder en el análisis de datos multiómicos y 'big data', así como en la aplicación de inteligencia artificial y aprendizaje automático en medicina aplicada. Destaca la reciente identificación de biomarcadores en cáncer de tiroides y leucemia infantil mediante técnicas avanzadas de análisis molecular. En este proyecto se desarrollarán modelos de inteligencia artificial y herramientas digitales basadas en datos moleculares que permitan identificar biomarcadores pronósticos en el cáncer de endometrio. «El objetivo es establecer un sistema de clasificación molecular y estratificación de riesgos que sea objetivo, reproducible y rentable que tenga el potencial de integrarse de manera rutinaria en la gestión terapéutica del cáncer de endometrio» afirma el investigador Mario Fernández Fraga. Y para ello, añade Agustín Fernández Fernández, otro de los coordinadores del proyecto, «examinaremos en detalle varias capas -ómicas del cáncer de endometrio en una cohorte de pacientes recopilada retrospectivamente en el HUCA en los últimos 20 años. Generaremos una cantidad masiva de datos moleculares a nivel genómico, epigenómico, transcriptómico y proteómico, para captar toda la complejidad molecular de esta enfermedad. La integración de datos multiómicos con los datos clínicos y con la ayuda de la inteligencia artificial facilitará la identificación de nuevas dianas moleculares complejas con fines terapéuticos, guiando una terapia más eficaz y específica«.
Los resultados de este proyecto, señalan sus investigadores, pueden suponer una mejora de la calidad de vida de las pacientes con cáncer de endometrio al aumentar su supervivencia, eliminar los efectos secundarios de terapias innecesarias o ineficaces, y reducir los daños psicológicos causados por esta condición oncológica tanto para las pacientes como para sus familias. De manera similar, este enfoque tendrá un impacto económico significativo al reducir los gastos de atención médica asociados con la administración de terapias innecesarias o ineficaces y la atención médica a un subconjunto de pacientes que no se beneficiarían de ellas.
«La caracterización molecular del cáncer de endometrio a través del Consorcio del Atlas del Genoma del Cáncer ha dado el pistoletazo de salida para un mejor conocimiento de la enfermedad que se traduce en el desarrollo de terapias más personalizadas. Por el momento, los avances en los tratamientos farmacológicos se están aplicando en pacientes con tumores en etapas avanzadas que, en el futuro, se trasladarán a situaciones más precoces con el objetivo de alcanzar más curaciones», explica Isabel Palacio, responsable de oncología ginecológica del HUCA, y miembro del equipo de investigación que llevará a cabo el proyecto. «Pese a todo, queda mucho por hacer en el conocimiento de este tumor y en saber por qué unas pacientes con cáncer de endometrio en etapas muy iniciales recaen durante el seguimiento. El Banco de Tumores del Principado de Asturias conserva muestras de pacientes diagnosticadas desde hace varios años mediante un trabajo laborioso de profesionales con gran implicación y visión de futuro. Este Banco posee también muestras de sangre de las mismas pacientes y de todas ellas disponemos de datos sobre la evolución que han tenido: si se han curado o han recaído, y de los resultados obtenidos con las terapias aplicadas», añade.
El cáncer de endometrio es uno de los cánceres ginecológicos más diagnosticados y ocupa el cuarto lugar en frecuencia entre las mujeres. Su aparición está relacionada con situaciones como la obesidad, la diabetes o la exposición a estrógenos por tiempo prolongado y, aunque no goza de la atención mediática de otros cánceres, tiene una gran relevancia por su heterogeneidad y su relación con estilos de vida que se puedan modificar.
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